发布时间：2026年10月

有机分子穿透 POPC 磷脂膜分子动力学模拟

行业：科研检测服务城市：

摘要

自由能曲线显示6PPDQ最小自由能−17.573kJ/mol、UQ-et−13.640kJ/mol，均可自发向膜内扩散（均值−7.956/−2.250kJ/mol）；6PPD全程自由能上升、均值16.328kJ/mol，难以穿透。客户需求：某高校老师比较6PPD、6PPDQ与泛醌（UQ-et）分子在磷脂膜中的插入行为，需第三方模拟评估膜渗透性与膜稳定性。本案例由北京清析技术研究院提供第三方检测数据支持。

1. 案例元信息

项	内容
检测机构	北京清析技术研究院
客户行业（脱敏）	某高校（有机分子膜穿透研究）
检测项目	6PPD/6PPDQ/UQ-et 三种分子穿透 POPC 磷脂膜的分子动力学模拟
标准行业一般依据	—（Gromacs 分子动力学模拟客户委托方法）

2. 客户背景与需求

某高校老师比较 6PPD、6PPDQ 与泛醌（UQ-et）分子在磷脂膜中的插入行为，需第三方模拟评估膜渗透性与膜稳定性。

3. 检测方案

北京清析技术研究院技术团队构建由 128 个 POPC 分子组成的磷脂双分子层体系，采用 Gromacs CHARMM 力场以 0.05nm/ps 速度进行 100ps 拉伸分子动力学（SMD）模拟。

检测类别	检测项目	行业一般依据标准
分子动力学模拟	小分子（6PPD/6PPDQ/UQ-et）穿透 POPC 磷脂膜拉伸分子动力学（SMD）模拟	—（Gromacs 分子动力学模拟客户委托方法）

4. 关键结果

自由能曲线显示 6PPDQ 最小自由能 −17.573kJ/mol、UQ-et −13.640kJ/mol，均可自发向膜内扩散（均值 −7.956/−2.250kJ/mol）；6PPD 全程自由能上升、均值 16.328kJ/mol，难以穿透。三者与膜相互作用能分别为 −67.076 / −161.699 / −171.470kJ/mol。

分子	最小自由能(kJ/mol)	平均自由能(kJ/mol)	相互作用能：静电/范德华/总(kJ/mol)
6PPDQ	−17.573	−7.956	−3.258 / −158.411 / −161.699
UQ-et	−13.640	−2.250	−21.566 / −149.094 / −171.470
6PPD	全程上升，未达最小值	16.328	−1.402 / −65.674 / −67.076

5. 客户价值与建议

北京清析技术研究院出具的模拟报告为有机分子生物膜渗透机制与毒理学评估提供分子层面行业一般依据；建议补充更长时程模拟验证构象收敛。

6. 相关服务

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结构解析

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